COVID-19 (COrona VIrus Disease-2019) Тема - 6

Притесненията нарастват заради новооткрития вариант на Covid-19 в Южна Калифорния

Скоростта, с която се появяват нови варианти през последните няколко месеца, е тревожна. Само през последните няколко седмици, заедно с избухването на вариантите в Обединеното кралство (B.1.1.7) и Южна Африка (B.1.351), бяха открити още в Бразилия, Охайо и сега Калифорния. Повишените нива на инфекции и смъртни случаи в Манаус, Бразилия, въпреки предишни инфекции, засягащи 76% от населението, служат като предупреждение, че нов вариант може да реинфекцира популация, заразена с по-ранен щам. Подобна ситуация може да се случи в Южна Калифорния . Тук ние разглеждаме тяхната ситуация по-подробно.

Едно от малкото енергични усилия за секвениране на генома на SARS-CoV-2 в САЩ идва от болница Cedars Sinai в Лос Анджелис. Анализирайки безброй проби в търсенето на опасните нововъзникващи варианти, изследователите откриха свой собствен щам още през юли. По това време е било само една проба, на която не са обърнали голямо внимание. Няколко месеца по-късно през януари и вариантът на Калифорния (CAL.20C) представлява половината от анализираните изолати.

CAL.20C има три уникални аминокиселинни заместители в протеина си. Шиповият протеин е частта от вируса, която взаимодейства и се закача към протеини от човешката клетка гостоприемник, по същество ключът към отварянето на гостоприемника към вируса. Сред тях са S13I и W152C в N-терминалния домейн и L452R в рецептор-свързващия домейн.

Възможно е S13I да повиши ефективността на разцепване на 12 амино-пептиден терминал, което може да увеличи обема на S-протеина върху клетката гостоприемник. Това би довело до по-заразен вирус. Освен това W152C може да повиши имунната устойчивост или ефективността на N-терминалния домейн или нещо друго. Нуждаем се от повече данни за тези две предположения, преди да можем да направим окончателни заключения от тези две замествания.

Заместването на L452R дава малко по-ясна представа. L452R замества хидрофобната аминокиселина левцин за аргинин. Страничната верига на аминокиселината не само е по-дълга, но и е заредена положително. За да разберете връзката между свързващия рецептора домейн и ACE2 рецептора, помислете за магнитни парчета пъзел. Не само формата трябва да съвпада точно за двете части, но и магнитните полюси трябва да бъдат подравнени. Разликата във формата или полярността може да повлияе на напасването на парчетата. L452R може да подобри напасването и зареждащото допълване на двете части.

Според предварителните данни от Центъра за изследване на рака на Фред Хътчинсън, който изолира разположения на мутации, за да тества имунно бягство, мутацията на мястото на 452 е избегнала малко повече от мутация на мястото на 501. N501Y обикновено се приписва на имунната резистентност на B.1.1.7. Ако тези предварителни данни са някакъв индикатор, CAL.20C може да успее да избяга от неутрализиращи антитела, както и B.1.1.7. Отново са необходими повече данни, за да се направят някакви заключения относно този нововъзникващ вариант, но колкото по-скоро знаем, толкова по-добре.

Вече знаем това, което спекулирахме дълго време: доморастените варианти на SARS-CoV-2 мутират точно под носа ни. Това е логично развитие, тъй като САЩ имат повече инфекции, отколкото всяка друга държава в света, досега. Сега знаем за съществуването на този и вариантите от Охайо. Вероятността повече да останат неоткрити е висока. Лабораториите в цялата страна трябва да следват примера на Cedar Sinai и да секвенират колкото се може повече проби. Идентифицирането на нововъзникващите варианти е първата стъпка към разбирането и контрола върху тяхното разпространение.

За съжаление, с появата на повече варианти, шансовете ваксините да покрият всеки вариант намаляват. Налични са достатъчно данни , които предполагат, че B.1.351 е до десет пъти имуноустойчив на няколко ваксини и вероятно може да реинфектира тези, които са били заразени преди това. Тъй като Р.1 носи много от едни и същи мутации, има голям шанс и той да е такъв.

По всяка вероятност ваксините срещу Covid-19 ще трябва да се адаптират ежегодно, както правим с грипа. Производителите ще трябва да познаят, както правят при грип, кои варианти на SARS-CoV-2 ще възникнат в кой регион и по кое време. Най-вече трябва да подсилим и засилим мерките за контрол на инфекциите в Съединените щати, въпреки очевидното намаляване на процента на инфекция. Ако тези варианти излязат извън контрол, ще се изправим пред друга голяма вълна от инфекции, хоспитализации и смъртни случаи. Вероятно ще живеем с Covid-19 дълго време. Въпросът е, можем ли да намерим начин за управление на разпространението на Covid-19 без значителната загуба на живот, която всички преживяхме през изминалата година?

https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/02/03/concern … ovid-19-variant/?

Забележете къде се появяват въпросните мутанти - Европа, САЩ, Бразилия и т.н. все места с много широко, почти безконтролно разпространение на вируса. Вирус, които не се репликира, не може да мутира.